Thesis:

Diseño, síntesis y evaluación de péptidos interferentes en la expresión in vitro del virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPNV)

Chile se ha consolidado como uno de los principales productores acuícolas del mundo, siendo el salmón su principal producto de exportación. Sin embargo, las enfermedades infecciosas continúan representando un desafío importante para la industria. Entre ellas, el virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPNV) constituye una amenaza significativa, responsable de pérdidas estimadas en 200 millones de dólares anuales a nivel mundial. Las estrategias actuales de control, principalmente las vacunas dirigidas a la proteína estructural VP2 del virus, presentan limitaciones, ya que no protegen las etapas tempranas del desarrollo del pez, donde la mortalidad es mayor. Además, el IPNV puede propagarse tanto vertical como horizontalmente, persistiendo en individuos infectados que actúan como portadores. En este contexto, la presente investigación tuvo como objetivo inhibir experimentalmente la expresión e infectividad del IPNV, empleando péptidos sintéticos diseñados, modelados bioinformáticamente y sintetizados químicamente para actuar sobre la proteína estructural VP2. Los ensayos se realizaron en la línea celular CHSE-214 de salmón, utilizando técnicas de RT-qPCR e inmunofluorescencia semicuantitativa, en modelos de infección persistente y de novo. De un total de 32 péptidos evaluados, se identificaron dos (GIM66 y GIM182) con capacidad inhibitoria significativa. GIM66 alcanzó una inhibición de hasta un 76% en infección persistente y un 99% en infección productiva, mientras que GIM182 mostró inhibiciones del 97% y 36% respectivamente. Posteriormente, se seleccionó el péptido GIM182 para estudios adicionales, confirmando su efecto inhibitorio sobre la replicación viral. Aunque no se logró la erradicación total del virus, los resultados demuestran el potencial de los péptidos sintéticos como alternativa biotecnológica para el control del IPNV, estableciendo las bases para futuras pruebas in vivo y el desarrollo de terapias biocompatibles en la industria salmonera.

Chile has become one of the world's leading aquaculture producers, with salmon as its main export product. However, infectious diseases remain a major challenge for the industry. Among them, infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) represents a significant threat, causing estimated losses of up to 200 million USD annually worldwide. Current control strategies, mainly vaccines targeting the structural VP2 protein, have limitations since they are not effective in the early developmental stages of fish, where mortality is highest. Moreover, IPNV can spread both vertically and horizontally, and current tools fail to eliminate infected carriers. This study aimed to experimentally inhibit the expression and infectivity of IPNV using synthetic peptides designed, bioinformatically modeled, and chemically synthesized to target the VP2 structural protein. Experiments were conducted in CHSE-214 salmon cell lines using RT-qPCR and semiquantitative immunofluorescence, under both persistent and de novo infection models. From 32 tested peptides, two (GIM66 and GIM182) exhibited significant inhibitory capacity. GIM66 achieved inhibition levels of up to 76% in persistent infection and 99% in productive infection, while GIM182 showed 97% and 36%, respectively. GIM182 was later selected for further detailed assays, confirming its inhibitory activity on viral replication. Although complete viral eradication was not achieved, the results demonstrate the potential of synthetic peptides as a biotechnological alternative for IPNV control, establishing a robust in vitro evaluation system and paving the way for in vivo testing and future applications in the salmon farming industry.